Με τη συμμετοχή του Ινστιτούτου Οπτικής και Όρασης και τη συνεργασία των τμημάτων Ιατρικής, Φυσικής και Μαθηματικών του Πανεπιστημίου Κρήτης, ξεκίνησε από τον Σεπτέμβριο του 2003 η λειτουργία διατμηματικού μεταπτυχιακού προγράμματος σπουδών με τίτλο «ΟΠΤΙΚΗ & ΟΡΑΣΗ» που οδηγεί στη λήψη Μεταπτυχιακού Διπλώματος Ειδίκευσης (Master) και πιο πρόσφατα Διδακτορικού Διπλώματος Ειδίκευσης (PhD). Σκοπός του ΠΜΣ είναι η δημιουργία στελεχών με υψηλό επίπεδο κατάρτισης ικανών να ακολουθήσουν σταδιοδρομία σε νοσοκομεία, ιατρικά κέντρα, ιδιωτικές επιχειρήσεις που σχεδιάζουν και αναπτύσουν συσκευές στους τομείς των επιστημών της όρασης, καθώς και σε Πανεπιστήμια και Ερευνητικά Ινστιτούτα ως επιστημονικό - ερευνητικό προσωπικό.